En la elección de presidentes municipales el PRI fue la fuerza política que mayor número de ayuntamientos ganó, con 81 triunfos de los 213 contabilizados por el Programa de Resultados Electorales Preliminares (PREP), seguido de la coalición “Por Puebla al Frente” (PAN, PRD, MC, PSI y CPP), con 69 municipios; en tercer lugar la coalición “Juntos Haremos Historia” (Morena, PT y PES), con 47 ayuntamientos, sin embargo, cabe destacar que esta última ganó los 15 municipios de mayor importancia en la entidad.
Del resto de municipios, nueve los ganó el Partido Verde Ecologista de México (PVEM); cinco, el Partido Nueva Alianza; y dos, candidatos independientes.
De acuerdo con los resultados del PREP, la coalición que encabeza el Movimiento Regeneración Nacional (Morena) obtuvo el triunfo en los municipios más importantes del estado y arrebató el control de aquellos gobernados por coaliciones panistas y por el PRI.
El caso más representativo es el de la capital del estado, donde actualmente gobierna una coalición encabezada por Acción Nacional, la cual a partir del próximo periodo tendrá que heredar la administración a Morena después del triunfo de Claudia Rivera Vivanco sobre el candidato panista, Eduardo Rivera Pérez.
En el segundo municipio más importante del estado como lo es Tehuacán será el gobierno priista de Ernestina Fernández quien entregue la administración a Morena, PT y PES después del triunfo de su candidato, Felipe de Jesús Patjane Martínez.
Esta misma situación se replica en municipios de importancia como Izúcar de Matamoros, San Andrés Cholula, Cuautlancingo, Coronango, Ciudad Serdán, Amozoc, Tepeaca y Tecamachalco.
En el caso de San Pedro Cholula, donde Morena es gobierno, logró mantener la administración con el triunfo de su candidato, Luis Alberto Arriaga Lila, al igual que lo hizo el PAN al retener el gobierno de Atlixco y el PRI en el caso de Santa Clara Ocoyucan.
Morena no fue el único partido que arrebató ayuntamientos a la coalición del PAN en esta elección, pues en el caso de Zacatlán ganó la alianza PRI-PANAL y en Teziutlán el ganador fue Compromiso por Puebla.
